可以。工程款仲裁申请提交后，当事人仍然能够补充新证据。仲裁程序没有一审、二审那种严格的举证期限锁死机制，只要在仲裁庭作出裁决前，材料与案件争点相关，通常都有机会提交。但“能交”不等于“一定被采纳”，更不等于“随时随便交”。时间点、理由、证据类型，都会影响仲裁庭的态度。
仲裁规则给补充证据留了口子
《仲裁法》第四十三条规定，当事人应当对自己的主张提供证据。仲裁庭认为有必要收集的证据，可以自行收集。这条没有把举证期限写死。
具体期限通常由仲裁委员会仲裁规则和仲裁庭的审理安排决定。多数机构会在受理后发出举证通知书，给一个举证期限，比如二十日或三十日。期限届满后提交的证据，叫逾期证据。
逾期证据不是当然无效。仲裁庭会看三件事：为什么逾期、证据是否关键、对方是否有机会质证。理由正当、内容关键、对方能当庭回应，仲裁庭一般会收。
工程款仲裁里，常见的新证据包括：结算审核报告、签证单、施工日志、监理指令、微信或邮件往来、付款凭证、鉴定意见补充说明。这些材料往往在开庭后才逐步浮现。
工程款仲裁中补充证据的时机与边界
开庭前补充，阻力最小。仲裁庭还没形成心证，双方也有时间准备质证意见。此时提交，基本按正常证据处理。
开庭中补充，要看是否影响庭审节奏。如果证据当庭能说明来源、对方能即时质证，仲裁庭多会允许。若需要对方大量时间核对，仲裁庭可能要求庭后书面质证。
开庭后、裁决前补充，门槛最高。仲裁庭已经完成事实调查，此时交新证据，等于要求重新开庭或重新评议。除非证据直接推翻关键事实，否则容易被认定为拖延程序。
裁决作出后再补充，已经没有意义。仲裁一裁终局，裁决书送达即生效。此时只能走撤销裁决或不予执行程序，而这两条路对证据的要求极严。
风险提示：逾期提交证据，仲裁庭可能不予采纳，也可能采纳但由提交方承担因此增加的仲裁费、对方差旅费等合理费用。工程款金额大，程序费用不低，拖延提交的代价要提前算。
补充证据对工程款仲裁当事人的实际影响
对申请人而言，补充证据可能直接改变请求金额。比如原申请只主张已完工程款，后来拿到签证单，可以追加变更增项款。但追加请求可能被要求另案申请或补缴仲裁费。
对被申请人而言，补充证据是抗辩工具。质量修复费用、工期延误损失、已付款凭证，都可以在答辩期后继续补。但拖到开庭后交，仲裁庭可能只作为参考，不单独组织质证。
对仲裁庭而言，补充证据增加工作量。仲裁庭要在效率与查明事实之间找平衡。工程款案件标的大、专业性强，仲裁庭通常愿意给合理机会，但不接受反复、零散、突袭式提交。
对和解谈判而言，新证据会改变双方预期。一份关键签证单或结算报告，可能让原本僵持的调解重新启动。证据强弱直接影响谈判桌上的报价。
怎么补充证据才稳妥
先看仲裁规则和举证通知书。上面写明的期限、形式、份数，必须遵守。电子证据要保留原始载体，复印件要准备与原件核对。
再写一份补充证据说明。写清证据名称、来源、证明目的、逾期原因。原因要具体，比如“该签证单由监理单位于某日才完成签章”，不要写“刚找到”。
同时主动提出质证安排。可以建议仲裁庭组织书面质证，或申请再次开庭。态度配合，仲裁庭更容易接受。
如果证据量大，先交核心部分。把最能影响裁决的几份先提交，其余整理成清单备查。不要一次性堆几百页，反而稀释重点。
对方提交新证据时，及时发表质证意见。对真实性、合法性、关联性逐项回应。不回应，等于放弃质证权利。
风险提示：不要伪造、变造证据。工程款仲裁中，伪造签章、倒签日期、修改结算数据，一旦被识破，不仅证据不被采纳，还可能承担妨害仲裁程序的责任，严重的涉及刑事风险。
现在可以做的下一步
翻出仲裁委员会的举证通知书和仲裁规则，确认当前处在哪个阶段。把手头所有与工程款相关的材料按时间顺序列一张表，标出哪些已交、哪些未交、哪些还没拿到。
对未交的关键证据，今天就整理成册，附一份补充证据说明，通过仲裁委员会认可的渠道提交，并保留提交凭证。同时给仲裁庭发一份简短说明，请求安排质证。工程款仲裁的结果，往往就藏在这些补交的细节里。